(一)訪查業主勘查現場及了解業主需求，建立聯絡窗口。 
(二)依據業主需求報價及契約書草案。 
(三)業主同意後正式成案，本會提供契約書，內含輔導規畫，業主確認無誤後進行簽約用印。雙方用印完成後，本會開立發票向業主申請第一期款。 
(四)依食品安全管制系統規範，提出硬體與軟體改善規畫方案。 
1.硬體 
(1)針對現場作業區人流、氣流、物流、水流進行規畫。 
(2)現場配置圖規劃、修改及審查。 
(3)配置圖修正確認後，業主進行施工，施工期間管制小組進行HACCP計劃書文件撰寫。 
(4)施工期完成後驗收確認，俟計畫書文件審查及員工教育訓練皆完成，進行測試運轉。 
2.軟體 
(1)建立HACCP、GHP制度。 
(2)成立HACCP管制小組，安排內部員工衛生教育訓練課程，可依實際需求調整課程，俟現場施工及計畫書文件審查完成，進行測試運轉。 
(3)進行HACCP計劃書文件撰寫。 
(4)俟施工驗收及員工教育訓練完成，本會協助計畫書文件校閱、修正及審查後，進行測試運轉。 
(5)計畫書文件修正完成後，本會開立發票向業主申請第二期款。 
(五)修繕工程、計畫書文件、教育訓練完成後，進行測試運轉，本會安排1-2次模擬內部稽核預評。 
(六)業主針對模擬內部稽核委員的缺失建議進行矯正改進，內部稽核預評完成及試運轉2個月後(建議至少有3個月以上的表單紀錄)，送件至衛生局申請評鑑。 
(七)評核通過，本會開立發票向業主申請第三期款。 
※整個輔導流程約6~12個月。